Za oblast srednjeg obrazovanja nadležna su ministarstva obrazovanja: u Republici Srpskoj Ministarstvo prosvjete i kulture RS, u Federaciji deset kantonalnih ministarstava obrazovanja i u Brčko Distriktu Odjeljenje za obrazovanje. Pravni osnov za realizaciju srednjeg obrazovanja su zakoni o srednjem obrazovanju pomenutih institucija zajedno sa podzakonskim aktima i propisima.U skladu sa propisima, svaka škola ima obavezu da sačini svoj razvojni plan, školski program i godišnji plan rada.Tim dokumentima se uređuje organizacija svih školskih aktivnosti.
Pored nadležnih ministarstava postoje i pedagoški zavodi koji su ili u nadležnosti ministarstava obrazovanja ili samostalni, ali je uloga ista. Oni su odgovorni za osiguranje kvaliteta obrazovanja, za standarde, za udžbenike i za druge aspekte značajne za funkcionisanje sistema obrazovanja
Srednja škola nije obavezna i traje od tri do četiri godine (razreda). Učenici obično upisuju srednju školu sa 15 godina, po završetku osnovne škole.
Kriterijumi za prijem u srednju školu su postignuti uspjeh u osnovnoj školi i rezultat prijemnog ispita.
U okviru srednjeg obrazovanja postoje sledeće vrste škola:
Opšte škole
Gimnazija (nastavni plan i program se izvodi u četverogodišnjem trajanju, čijim završavanjem učenik stiče srednju školsku spremu i mogućnost nastavka školovanja)
Umjetnička škola (muzička, likovna i druga, što se određuje prema vrsti nastavnog plana i programa, u četverogodišnjem trajanju, čijim završavanjem učenik stiče srednju školsku spremu i mogućnost nastavka školovanja)
Vjerska škola (nastavni plan i program se izvodi u četverogodišnjem trajanju, čijim završavanjem učenik stiče srednju školsku spremu i mogućnost nastavka školovanja)
Stručne škole
Tehničke, ekonomske, medicinske i druge stručne škole, što se određuje prema vrsti nastavnog plana i programa, i to u trajanju od: tri godine, čime se završava program za sticanje srednje stručne spreme bez pristupa visokom obrazovanju, i u trajanju od četiri godine čijim završavanjem učenik stiče srednju školsku spremu i mogućnost nastavka školovanja)
Škole su uglavnom javne i besplatne, mada postoje i privatne škole. Nastava se izvodi na jednom od tri jezika koji su u službenoj upotrebi u zemlji.Obrazovanje učenika sa posebnim potrebama organizuje se uz primjenu posebnih programa u redovnim ili posebnim razredima srednjih škola, a učenici sa većim teškoćama u razvoju obrazuju se u posebnim ustanovama.Obrazovanje poslije završene srednje škole, a koje nije visoko obrazovanje su danas Programi stručne obuke, a po starom obrazovnom programu to su bili programi tkz. V stepena ili sticanje VKV stručne spreme. Oni traju1 godinu nakon završetka srednjeg tehničkog obrazovanja za sticanje kvalifikacije "specijalista" ili 2 godine nakon završetka srednjeg stručnog 3-godišnjeg programa za sticanje kvalifikacije "majistor".