Studijski programi druge razine izvode se kao diplomski sveučilišni studijski programi ili kao specijalistički stručni diplomski studijski programi.
Minimalni obrazovni kriterij za upis na diplomske sveučilišne programe je završetak preddiplomskog sveučilišnog programa. Sveučilišta upis na diplomske sveučilišne programe mogu dopustiti i studentima koji su završili stručni studijski program, ali dopušteno im je u tom slučaju postaviti posebne zahtjeve. Minimalni obrazovni zahtjev za upis u specijalističke diplomske stručne programe jest završen preddiplomski sveučilišni program ili stručni program (prva razine). Prema pregledniku studijskih programa AZVO-a postoje 444 studijska programa druge razine, od čega je većina iz područja društvenih znanosti.
Diplomski sveučilišni studiji (programi druge razine) obično traju dvije godine, za čijeg trajanja studenti prikupljaju 120 ECTS bodova. Manji dio diplomskih programa u Hrvatskoj izvode se kao jednogodišnji programi za čijeg trajanja studenti prikupljaju 60 ECTS bodova. Ukupni broj bodova prikupljenih tijekom programa prve i druge razine je najmanje 300. Po završetku programa studenti dobivaju diplomu i akademski naziv magistar ili magistra, s naznakom područja specijalizacije. Studenti koji steknu sveučilišni stupanj druge razine mogu nastaviti studiranje na poslijediplomskim sveučilišnim programima ili pristupiti tržištu rada.
Specijalistički diplomski stručni studiji obično traju dvije godine, tijekom kojih studenti prikupljaju 120 ECTS bodova. Manji dio specijalističkih stručnih diplomskih programa u Hrvatskoj izvodi se kroz jednogodišnje programe u kojima studenti prikupljaju 60 ECTS bodova. Ukupni broj ECTS bodova prikupljenih tijekom studiranja programa prve i druge razine je barem 300. Po završetku specijalističkog diplomskog stručnog studija studenti dobivaju diplomu i stručni naziv stručnog specijalista ili stručne specijalistice za određeno područje. Studenti koji diplomiraju u području medicine, dentalne ili veterinarske medicine dobivaju stručni naziv diplomirani ili diplomirana uz naznaku područja studiranja.