Glavni instrument mobilnosti u odgoju i obrazovanju je Program cjeloživotnog učenja (LLP). Program provodi nacionalna Agencija za mobilnost i programe EU (AMPEU). Program cjeloživotnog učenja obuhvaća da dva sektorska potprograma koji su usredotočeni na mobilnost u ranom djetinjstvu i na školskoj razini – Comenius i Leonardo da Vinci.

Program Comenius usredotočen je na sve razine školskog odgoja i obrazovanja, od predškolskog i osnovnog do srednjoškolskog. On je relevantan za sve koji su uključeni u školski odgoj i obrazovanje: uglavnom učenike i nastavnike, ali i na lokalne vlasti, predstavnike udruga roditelja, nevladine udruge, institute za usavršavanje nastavnika i sveučilišta.

Školska partnerstva u okviru Comeniusa mogu biti bilateralne naravi, kreirana za najmanje desetodnevne recipročne razmjene između dvije zemlje, ili višestruka partnerstva usmjerena na suradnju škola iz više zemalja o osnovnoj temi kojom se te one bave. Regionalna partnerstva su smišljena kako bi se povećalo lokalnu i regionalnu suradnju organa nadležnih za odgoj i obrazovanje. Hrvatska je također uključena u pojedinačnu mobilnost učenika u okviru Comeniusa, kroz usavršavanja u trajanju od tri do deset mjeseci u školama-primateljicama u inozemstvu. Hrvatske su škole vrlo aktivne u aktivnosti pod nazivom eTwinning. eTwinning nudi informacijsko-komunikacijsku platformu za nastavnike i ostalo osoblje koje sudjeluje u procesu odgoja i obrazovanja, a koji rade u školi u jednoj od uključenih europskih zemalja, da komuniciraju, surađuju i razvijaju zajedničke projekte.

Program Leonardo da Vinci financira praktične projekte u području strukovnog obrazovanja i usavršavanja. Program učenicima nudi pojedinačnu mobilnost. Učenici su uključeni u inicijalno strukovno i tehničko obrazovanje. Mobilnost učenika može trajati od 2 do 39 tjedana. Svrha ovakve mobilnosti je pronalazak radnog mjesta ili mogućnosti usavršavanja u inozemstvu. Akcija Partnerstvo Leonardo da Vinci povezuje obrazovne institucije, poduzeća i socijalne partnere s međunarodnim i lokalnim aktivnostima istovremeno.

Program financiranja međunarodne suradnje škola program je Ministarstva znanosti, obrazovanja i sporta kojim se komplementira europska suradnja dostupna školama u okviru Programa za cjeloživotno učenje Europske unije, odnosno njegova potprograma Comenius. Mogućnost ovakve bilateralne suradnje škola dostupna je isključivo sa školama u onim europskim zemljama koje ne sudjeluju u Programu za cjeloživotno učenje te za suradnju s ustanovama koje provode obrazovanje pripadnika hrvatske manjine.

Ministarstvo znanosti, obrazovanja i sporta nacionalni je koordinator Akademije srednjoeuropskih škola (ACES).ACES je projekt/mreža inicirana od Interkulturnog centra iz Beča pod pokroviteljstvom Zaklade Erste. Projekt implementira multilateralnu suradnju osnovnih i srednjih škola, sa svrhom promoviranja ideje "Europskih vrijednosti" kao što su multikulturalnost, međusobno razumijevanje, solidarnost i mirni suživot svih ljudi/građana Europe. Uz Hrvatsku, članice ACES-a su još 14 zemalja srednje i istočne Europe. Od 2008. godine, ACES projekt se provodi i pod pokroviteljstvom UNESCO-a.

AMPEU također provodi program Mladi na djelu. Program nudi financijsku potporu za neformalno učenje i mobilnost mladih (do 13.-e do 30.-e) što pridonosi ciljevima europske suradnje koja se tiče mladih. Razmjene mladih unutar programa (do 15 mjeseci) nude prigodu mladima iz različitih zemalja da se okupe i raspravljaju o specifičnim temama u širem europskom kontekstu. Program za mlade zahtijeva suradnju sa susjedima u zemljama Europske unije (u trajanju od 15 mjeseci), omogućava razmjene mladih, usavršavanje i umrežavanje (networking). Akcija Europska dobrovoljna služba (European Voluntary Service) daje potporu suradnji različitih oblika dobrovoljnih aktivnosti, unutar i izvan Europske unije.

Pojedinačne stipendije u okviru Comeniusa dostupne su pripravnicima ili djelatnim nastavnicima, kao i ostalom osoblju uključenom u formalni ili neformalni sustav odgoja i obrazovanja. Pojedinačne stipendije pružaju potporu u pronalasku radnog mjesta u inozemstvu ili sudjelovanje u programima usavršavanja s drugim europskim kolegama.

Program Leonardo da Vinci za stručnjake u strukovnom obrazovanju pruža priliku za poboljšanje kompetencija nastavnika, instruktora, mentora te profesionalaca koji se bave usavršavanjem i za suradnju sa malim i srednjim poduzetništvom. Daje se potpora studijskim posjetima u trajanju od 1 do 6 tjedana.

Program za usavršavanje nastavnika Pestalozzi program je Vijeća Europe koji omogućava zemljama članicama organizaciju seminara za nastavnike u trajanju do sedam dana o temama koje se tiču projekata Vijeća Europe. Program provodi Agencija za odgoj i obrazovanje.

Radna skupina za međunarodnu suradnju u području obrazovanja, sjećanja i istraživanja o holokaustu (Task Force for International Co-operation on Holocaust Education, Remembrance an Research – ITF) sastoji se od predstavnika vlada i nevladinih udruga s ciljem poticanja aktivnosti o obrazovanju o holokaustu, sjećanju i istraživanju u zemljama članicama i drugim zainteresiranim zemljama te u davanju političke potpore ovim aktivnostima u nacionalnim i međunarodnim kontekstima. Ovu suradnju provodi Ministarstvo znanosti, obrazovanja i sporta,a uključuje stipendije za nastavnike koji poučavaju o holokaustu u suradnji s Međunarodnim centrom u Yad Vashemu te distribuciju brojnih edukativnih materijala hrvatskim školama.

Ministarstvo znanosti, obrazovanja i sporta podupire i financira različite tipove projekata i programa u području učenja stranih jezika. Oni uglavnom izviru iz bilateralne suradnje. Ministarstvo znanosti, obrazovanja i sporta također omogućava usavršavanje za nastavnike hrvatskog jezika koji ga poučavaju u inozemstvu. Ovaj tip seminara organizira Agencija za odgoj i obrazovanje.