Ministarstvo znanosti, obrazovanja i sporta središnje je nacionalno upravljačko tijelo sustava obrazovanja u Hrvatskoj. U upravljanju sustavom na nacionalnoj razini uz ministarstvo sudjeluje i niz agencija: Agencija za odgoj i obrazovanje, Agencija za strukovno obrazovanje i obrazovanje odraslih, Agencija za znanost i visoko obrazovanje, Agencija za mobilnost i programe EU-a te Nacionalni centar za vanjsko vrednovanje obrazovanja .

Ministarstvo i Agencije akreditiraju i nadziru provedbu obrazovnih programa ustanova na svim razinama.

Ministarstvo također osigurava sredstva za plaće nastavnog osoblja - što je najveći dio ukupnog proračuna za obrazovanje - za sve razine obrazovanja, osim za najnižu razinu (predškolski odgoj i obrazovanje) koji se osigurava iz sredstava lokalne samouprave .

Na razini srednjoškolskog obrazovanja, institucije regionalne samouprave i obrazovne ustanove imaju zakonske ovlasti i odgovornosti za sudjelovanje u imenovanju ravnatelja i zapošljavanju drugih zaposlenika ustanova.