Haridussüsteemi juhtimisel lähtutakse otstarbeka detsentraliseerimise põhimõttest, s.t koolid on suhteliselt autonoomsed ja koolijuhtidel on suur otsustusvabadus.

Haridusasutust juhib juhataja, direktor või rektor. Haridusasutuse juhi määrab ametisse omanik, kui haridusasutuse põhikirjas ei ole ette nähtud teisiti. Täiskasvanute täienduskoolitust pakuvad ülikoolid, rakenduskõrgkoolid, kutseõppeasutused, samuti kultuurimajad, raamatukogud ja muud kultuuriasutused; keeltekoolid, rahvakõrgkoolid, arendus- ja õppekeskused; koolitusega tegelevad ettevõtted, seltsid, liidud ja ühingud, kelle põhikirjas on nimetatud koolituse andmine.

Haridusasutuse juhi õigused ja kohustused kehtestatakse õigusaktides ja haridusasutuse põhikirjas.