Do roku 1990 prebiehalo riadenie školstva na centrálnej úrovni. Zákon č. 542/1990 Zb. o štátnej správe v školstve a školskej samospráve nahradil dovtedajší zákon a vytvoril odvetvový systém riadenia, a tým podmienky pre pluralitný rozvoj školstva a podmienky na posilnenie samostatnosti škôl.
Zákon č. 596/2003 o štátnej správe v školstve a školskej samospráve v znení neskorších predpisov vymedzuje nové kompetencie rozhodujúcich subjektov, ktoré v systéme pôsobia – obce, samosprávne kraje, samosprávne školské orgány, orgány štátu zabezpečujúce odborné a metodické riadenie a riaditelia škôl a školských zariadení.
Zákon udáva dve formy kompetencií územnej samosprávy (t.j. obcí a samosprávnych krajov):
- prenesený výkon štátnej správy a
- výkon územnej samosprávy (tzv. samosprávne kompetencie).
Reforma verejnej správy (štátnej správy a územnej samosprávy) priniesla zmeny aj v organizácii vzdelávacieho systému. Predovšetkým v oblasti riadenia, zriaďovania a zrušovania škôl a školských zariadení a samosprávy škôl. Zmeny sú zakotvené v legislatíve zákonom o štátnej správe v školstve a školskej samospráve. V roku 2008 bol schválený a nadobudol účinnosť nový školský zákon o výchove a vzdelávaní, ktorý vytvoril legislatívny priestor na uskutočnenie obsahovej reformy regionálneho školstva.
Ministerstvo školstva, vedy, výskumu a športu Slovenskej republiky je ústredným orgánom štátnej správy pre materské školy, základné, stredné a vysoké školy, školské zariadenia, celoživotné vzdelávanie, vedu a techniku, pre štátnu starostlivosť o mládež a šport.
Ministerstvo v rozsahu svojej pôsobnosti zriaďuje rozpočtové organizácie a príspevkové organizácie, kontroluje a hodnotí ich činnosť. Ministerstvo riadi školy a školské zariadenia na území Slovenskej republiky prostredníctvom všeobecne záväzných pravidiel. Poskytovaním odborného poradenstva zriaďovateľom spravuje sieť škôl a školských zariadení v Slovenskej republike.
Na lokálnej úrovni je štátna správa školstva zabezpečovaná prostredníctvom obcí a vyšších územných celkov, ktoré zabezpečujú činnosti vyplývajúce z ich zriaďovateľských kompetencií.
Vysoké školy sú právnické osoby a o ich organizácii a činnosti rozhodujú orgány akademickej samosprávy v súlade so zákonom o vysokých školách v znení neskorších predpisov.
Legislatíva
Národná rada Slovenskej republiky, 2002. Zákon č. 131/2002 Z.z. o vysokých školách a zmene a doplnení niektorých zákonov (sprístupnené 07/01/2020).
Národná rada Slovenskej republiky, 2008. Zákon č. 245/2008 Z.z. o výchove a vzdelávaní (školský zákon) a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov (sprístupnené 07/01/2020).
Národná rada Slovenskej republiky, 2009. Zákon č. 568/2009 Z.z. o celoživotnom vzdelávaní a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov (sprístupnené 03/06/2019).
Národná rada Slovenskej republiky, 2003. Zákon č. 596/2003 Z.z. o štátnej správe v školstve a školskej samospráve a o zmene a doplnení niektorých zákonov v znení neskorších predpisov(sprístupnené 07/01/2020).