Organizační varianty předškolního vzdělávání
Od školního roku 2016/17 se lesní mateřské školy, které splňují zákonné podmínky, staly oficiálním typem mateřské školy. Podle školského zákona vzdělávání v lesních mateřské škole probíhá především ve venkovních prostorách a škola nemá klasickou školní budovu. Ve většině aspektů (obsah vzdělávání, řízení a financování, kvalifikace učitelů) pro ně platí pro ně stejná pravidla jako pro běžné mateřské školy. Jsou na ně však kladeny snížené hygienické nároky. Naopak je vyžadován nižší počet dětí ve třídě a nižší počet dětí na pracovníka. Omezena je také délka pobytu ve škole. Lesní mateřské školy všech typů i některé ekoškolky (viz níže) sdružuje Asociace lesních MŠ.
Skupiny pro jazykovou přípravu v mateřských školách
Pro děti-cizince, na které se vztahuje povinné předškolní vzdělávání, se zřizují skupiny pro jazykovou přípravu, pokud je v mateřské škole 4 a více těchto dětí, při menším počtu dětí se poskytuje individuální jazyková příprava.
Výuka v jazyce národnostní menšiny v mateřských školách
Příslušníkům národnostních menšin se zajišťuje právo na vzdělávání v jazyce národnostní menšiny. Ve školním roce 2021/22 v České republice fungovalo 24 mateřských škol vzdělávajících 854 dětí v polském jazyce. (Zdroj: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy.)
Alternativní pedagogické směry v mateřských školách
Mateřské školy pracují se značnou organizační volností. Ze zavedených alternativních struktur působí několik mateřských škol waldorfského typu, mateřské školy Montessori a školy křesťanského zaměření.
Na základě mezinárodního programu Step by step se od roku 1994 realizuje jeho česká varianta pod názvem Začít spolu, implementovaná a monitorovaná společností Step by Step ČR, o. p. s. Jeho význačným rysem je inkluzivní přístup k etnickým minoritám a dětem ze sociálně málo podnětného prostředí. Pracuje podle něj přes 200 mateřských a základních škol (2020).
Novým trendem je zaměření předškolního vzdělávání na ekologii. Jde buď o tzv. ekoškolky, které kladou oproti běžným mateřským školám větší důraz na ekologickou výchovu, anebo o výše uvedené lesní mateřské školy.
Mateřské školy při zdravotnických zařízeních
Za organizační variantu mateřské školy lze považovat též školy při zdravotnických zařízeních.
Přípravné třídy se zřizují při základních školách pro děti v posledním předškolním ročníku (přednostně pro děti s odkladem povinné školní docházky), u kterých je předpoklad, že toto vzdělávání vyrovná jejich vývoj. Plní zde povinné předškolní vzdělávání.
Domácí vzdělávání během povinného předškolního vzdělávání
Povinné předškolní vzdělávání je možné plnit také formou individuálního (domácího) vzdělávání, které se uskutečňuje bez pravidelné účasti ve vyučování ve škole.
Alternativní předškolní zařízení
Kromě mateřských škol a přípravných tříd existují pro starší děti další typy předškolních zařízení.
Projekt Centra pro předškolní děti vznikl v hlavním městě Praze v reakci na nedostatek míst v mateřských školách. Tato centra jsou provozována v domech dětí a mládeže (zařazených ve rejstříku škol a školských zařízení) v dopoledních hodinách formou celotýdenních programů v rámci zájmového vzdělávání pro předškolní děti, a to jak pro příležitostné, tak i pro pravidelné návštěvníky. Důraz je kladen na rozvoj pohybových, hudebních, výtvarných a herních aktivit a osobnostně sociální rozvoj. Projekt vychází z Rámcového vzdělávacího programu pro předškolní vzdělávání. Maximální počet dětí v jedné skupině je 15 ve věku zpravidla 3–6 let. Děti vede vždy dvojice zkušených a kvalifikovaných pedagogů.
Zařízení neziskových organizací
Neziskové organizace (spolky či obecně prospěšné společnosti) mohou provozovat zařízení pouze na základě obecných legislativních předpisů (např. různé předškolní kluby). Organizace mohou žádat o dotaci z programů Ministerstva školství, mládeže a tělovýchovy nebo finanční podporu na projekty z fondu Evropského sociálního fondu.
Zařízení pro děti od 3 let na základě živnosti
Zařízení pro děti od 3 let mohou fungovat na základě volné živnosti Mimoškolní výchova a vzdělávání, pořádání kurzů, školení, včetně lektorské činnosti. Součástí živnosti je i „výchova dětí nad tři roky věku v předškolních zařízeních, pokud tato nejsou zařazena do rejstříku škol a školských zařízení“, zařízení tedy neposkytují vzdělávání. Řídí se stejnou hygienickou vyhláškou jako mateřské školy, v ostatních ohledech (vzdělávací dokumenty, kvalifikace pedagogů, počet dětí na skupinu atd.) pro ně však žádná oficiální pravidla neexistují. Zařízení podléhají kontrole živnostenských úřadů.
Dětská centra při azylových zařízeních
Děti žadatelů o udělení mezinárodní ochrany v předškolním věku mají k dispozici tzv. dětská centra, která jsou součástí azylových zařízení.